La disposition des plates-formes produit un gradient de microclimats, le centre des plates-formes circulaires ayant une température plus élevée et diminuant progressivement vers l'extérieur à des températures plus basses, pouvant ainsi simuler jusqu'à 20 types de microclimats différents. Les microclimats des plates-formes qui entourent le plus grand entonnoir (Qechuyoq) sont répartis en secteurs de quatre niveaux contigus, chaque secteur ayant ses propres caractéristiques microclimatiques. Les quatre plates-formes inférieures qui appartiennent au secteur 1 sont plus humides et ont des températures de sol plus basses en raison de la plus grande évapotranspiration de l'eau. Les sols des plates-formes du secteur 2 ont des températures annuelles moyennes de 2º à 3ºC plus élevées. Les sols du secteur 3 ont des températures qui peuvent être supérieures ou inférieures selon la variation de l'exposition solaire au cours des saisons de l'année. Les mois avec la plus grande différenciation microclimatique sont ceux de la saison sèche (mai, juin, juillet) et de la saison des semis (août, septembre, octobre, novembre). Différents types de produits pourraient être plantés, selon des études, à
Moray, les Incas ont réussi à cultiver plus de 250 types de légumes. Mais certains érudits de l'Empire Inca parlent de
Moray comme d'un centre également dédié à l'observation astronomique et à la prédiction des phénomènes météorologiques.